Simple Sequence Repeat-Based Genetic Diversity and Analysis of Molecular Variance among on-Farm Native Potato Landraces from the Influence Zone of Camisea Gas Project, Northern Ayacucho, Peru

Abstract

La papa nativa andina, es importante para la seguridad alimentaria, constituye un reservorio de genes para el mejoramiento del cultivo. Con el objetivo de establecer el estado actual de la diversidad de papas nativas en la zona de influencia del Proyecto Peruano Gas de Camisea en el norte del departamento de Ayacucho, Perú se colectaron 144 variedades locales en tres distritos (Anco, Chungui y Ticllas). Usando diez marcadores SSR se amplificaron 67 alelos polimórficos. Los análisis de componentes principales, de correspondencia múltiple y de agrupamiento revelaron que se podría usar un set mínimo de seis SSR para el ADN fingerprintig y análisis de diversidad genética costo-efectivo. El AMOVA, el índice promedio de fijación (FST = 0.279) y el índice de distancia genética (SB) muestran que la diversidad genética a nivel intra e inter-poblacional es alto, las tres poblaciones difieren genéticamente, contienen genotipos únicos y alelos exclusivos. El 10.41% de papas nativas estaban mal identificados.